并购完成后，法律问题仍未结束，因为无论员工问题及其他权利义务整合问题都尚待解决。
(一)、员工问题
并购后紧接着裁员几乎是并购之惯例，此时，被裁掉的员工可以依原聘雇契约，向新雇主主张劳基法上权利，要求资遣费，续任员公亦可要求新雇主承认其旧年资。
(二)、契约整合
公司合并后，原始签约主体可能已经消灭，而存续公司体质亦已不同，契约或须另为通知、或须重行谈判甚至要求解约(例如甲公司与乙公司合并，甲原须丙公司支援，但合并后，此项支援已可由乙公司提供，故甲公司即须与丙公司谈解约)，各项权利义务之重行界定及谈判，委实极复杂，往往须历经数月甚至数年亦无法圆满。
(三)、无形资产整合
于现今世界，智慧财产之价值往往更甚于有形资产，故对有关商标专利及其他智慧产权须为整体整合，此皆将成为将来营运之利器，至于有涉讼案件，亦须整理结清，并告知管理阶层，以免误触地雷。
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